在离婚案件中，有两个孩子的抚养权分配通常遵循以下原则：
协商决定
父母双方可以通过协商来决定每个孩子的抚养权归属。如果双方能够达成一致意见，可以签订离婚协议，明确孩子的抚养权分配。
诉讼争取
如果协商无果，父母可以通过法律途径争取抚养权。法院在审理时会综合考虑多种因素，包括孩子的年龄、健康状况、成长环境、父母的经济能力和抚养条件等。
哺乳期内的孩子：通常指两周岁以下的婴幼儿，原则上由母亲抚养，但若有特殊情况，如母亲存在健康问题或无法履行抚养义务，孩子也可随父亲生活。
两周岁以上的孩子：父母双方应首先通过协议决定抚养权。若无法达成一致，法院将根据双方抚养能力和条件，以及有利于孩子健康成长的原则来裁决。
八周岁以上的孩子：法院在裁决抚养权时，会充分尊重孩子的意愿，但并非孩子可以随意选择。通常是在父母双方条件相当，且都争取抚养权的情况下，才会考虑孩子的意见。
与祖父母或外祖父母长期生活的孩子：若孩子长期与祖父母或外祖父母生活，且他们有能力并愿意继续照顾孩子，这可能会成为抚养权归属的一个优先条件。
抚养费问题
若两个孩子抚养权归一方所有，另一方通常需要支付抚养费。抚养费的具体数额通常根据一方收入的20-30%来确定，并包括生活费、教育费、医疗费等。
如果一方不支付抚养费，另一方可以以孩子作为原告，抚养孩子一方作为法定代理人起诉，要求支付抚养费。
建议
协商优先：在离婚过程中，尽量通过协商达成一致，以减少诉讼带来的时间和精力消耗。
了解法律：双方应充分了解相关法律规定，以便在协商或诉讼过程中能够更好地维护自己的权益。
考虑孩子的最佳利益：无论最终抚养权如何分配，都应确保孩子的身心健康和最大利益得到保障。
通过以上原则和规定，父母可以更加明确地在离婚时处理两个孩子的抚养权问题。
